Xuất nhập khẩu tại chỗ không phản ánh đúng bản chất của hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu theo pháp luật về thương mại và quản lý ngoại thương là hàng hoá phải được đưa ra, hoặc đưa vào lãnh thổ Việt Nam. Việc áp dụng chính sách quản lý như đối với hàng hóa xuất nhập khẩu thông thường khiến doanh nghiệp có thể lợi dụng để gian lận thương mại, gây khó khăn cho cơ quan hải quan trong công tác quản lý.